在医学研究中合理地选择好实验动物是非常重要的，不同的实验有不同的目的要求，而各种动物又有自己的生物特点和解剖生理特征。如果选择得当，则可用少量的人力、动物和时间，以最小的代价最大限度地获得可靠的实验结果。否则，不仅造成不必要的浪费，更严重的是会影响实验结果的判断。因此应选择那些结构、机能、代谢和人类相似的动物进行实验。大型灵长类动物数量少，价格昂贵，不易获得，而且遗传和微生物控制较困难，一般在医学实验中较少使用，而用一般动物替代。如：狗具有发达的血液循环和神经系统，消化过程与人相似，适用于作营养学、毒理学、生理学及实验外科学研究。两栖类的蛙和蟾蜍，大脑很不发达，和人类相差甚远，当然不能用于高级神经活动的研究，进行简单的反射弧试验，选用蛙很合适，因为最简单的反射中枢位于脊髓，而蛙的脊髓已发展到适合该实验要求的阶段，结构简单，容易分析，而高等动物的反射弧复杂而难于分析。兔的主动脉神经（减压神经）自成一束，多用于减压反射或减压神经放电实验。豚鼠耳蜗较发达，常用于引导耳蜗微音器电位。大鼠、狗、猫的心脏比兔心更强更持久，所以常用于血流动力学及冠状循环的研究。

为了充分利用好动物，节省经费，可在不影响实验结果的情况下，在同一动物身上进行不同的实验内容。如：用兔取心脏、小肠分别做离体灌流实验。胸内负压与呼吸运动调节，膈神经放电实验可先后结合起来。皮层诱发电位与大脑皮层运动机能定位及去大脑僵直实验可结合起来。在同一只蛙上可先做期前收缩或代偿间歇实验，再做蛙心起搏点观察。